Bioanalytik II

Abteilung Biophysik Group / Nussberger Lab

Die moderne Bioanalytik trägt in unterschiedlichen Bereichen der Biowissenchaften zur Lösung anspruchsvoller Aufgabenstellungen bei. Wichtige Werkzeuge sind die klassische Röntkenkristallographie sowie die Methode der Kryo-Elektronenmikroskopie zur dreidimensionalen Strukturbestimmung großer makromolekularer Komplexe, die Super-Resolution-Mikroskopie zur Auflösung von Objekten unterhalb des Beugungslimits von 200 nm sowie die hochauflösende Einzelmoleküleanalyse mit Nanoporen-Arrays. Die Vorlesung Bioanalytik II befasst sich mit diesen Themen; sie ist konzipiert für Studierende in den Masterstudiengängen Technische Biologie und Medizintechnik.

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ILIAS

Allgemeine Informationen

Dozenten
Semester

Winter

Umfang

12 ETCS (inklusive Praktikum) oder 6 ETCS (ohne Praktikum)

Sprache

Deutsch oder Englisch

Termine

Donnerstags 9:45 - 11:15 Uhr / PWR 57 V9.330

  • Seit dem Wintersemester 2022 sind alle Vorlesungen durch Veranstaltungsaufzeichnungen, die in ILIAS zum Download hinterlegt werden, begleitet. Angaben zu den Terminen sind auf CAMPUS hintelegt.

In der Vorlesung werden die folgenden Tmenen behandelt:

  • Thema 1: Grundlagen der Röntgenkristallographie
    • 3D Kristallisation von Proteinen, Kristallsymmetrien
    • Bravais Gitter, Fouriettheorie, Patterson Funktion
    • Ewaldkonstruktion
    • Lösung des Phasenproblems
  • Thema 2: Grundlagen der Cryo-Transmissionselektronenmikroskopie 
  • Thema 3: Super-Resolution-Mikroskopie
    • Optischen Nahfeldmikroskopie und totale interne Reflexions-Fluoreszenzmikroskopie (TIRFM)
    • Stochastische optische Rekonstruktionsmikroskopie (STORM) und photoaktivierte Lokalisationsmikroskopie (PALM)
    • Stimulated Emission Depletion Microscopy (STED)
  • Thema 4: Methoden zur Manipulation einzelner Moleküle
    • Optische Pinzette
    • Rastersondenmikroskopie (AFM, SNOM)
  • Thema 5: Elektrophysiologisch Methoden
    • Patch Clamp
    • Single Molecule DNA Sequencing
    • Droplet Hydrogel Bilayer
Informationen
  • Eine aktuelle Übersicht mit Vorlesungsterminen finden Sie in C@MPUS.
  • Alle Unterlagen stehen im ILIAS-Kurs zum Download bereit.
Literatur
  • Bernhard Rupp, Biomolecular Crystallography: Principles, Practice, and Application to Structural Biology (Garland, 2010)
  • Paul R. Selvin and Taekjip Ha, Single-Molecule Techniques (Cold Spring Harbor Laboratory Press 2008)
  • Igor N. Serdyuk, Nathan R. Zaccai and Jospeph Zaccai, Methods in Molecular Biophysics (Cambridge, 2007)
  • Lottspeich, Engels (Hrsg.) Bioanalytik (Springer Spektrum) 
  • Joseph R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy (Springer, 2006) 
  • Seminararbeit und Vortrag zu einem Thema der molekularen Bioanalytik
  • Abgabe der Seminararbeit und Termin des Vortrags: n.V. Ende des Semesters
  • Erfolgreiche Teilnahme am Praktikum Bioanalytik II

Kontakt

 

Abteilung Biophysik, Institut für Biomaterialien und biomolekulare Systeme, Universität Stuttgart

Pfaffenwaldring 57 , D-70569 Stuttgart, Germany

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